Дизајн шема и раствор на полипептиден пептиден синџир

I. Резиме
Пептидите се специјални макромолекули, така што нивните секвенци се невообичаени по нивните хемиски и физички карактеристики.Некои пептиди тешко се синтетизираат, додека други се релативно лесни за синтеза, но тешко се прочистуваат.Практичниот проблем е што повеќето пептиди се малку растворливи во водени раствори, така што при нашето прочистување, соодветниот дел од хидрофобниот пептид мора да се раствори во неводени растворувачи, затоа, овие растворувачи или пуфери најверојатно се сериозно неконзистентни со употребата на биолошки експериментални процедури, така што на техничарите им е строго забрането да го користат пептидот за свои цели, така што следните се неколку аспекти на дизајнот на пептидите за истражувачите.

Дизајн шема и раствор на полипептиден пептиден синџир
Второ, правилен избор на синтетички тешки пептиди
1. Вкупна должина на надолу регулираните секвенци
Пептидите со помалку од 15 остатоци се полесно да се добијат бидејќи големината на пептидот се зголемува и чистотата на суровиот производ се намалува.Бидејќи вкупната должина на пептидниот синџир се зголемува над 20 остатоци, прецизното количество на производот е клучна грижа.Во многу експерименти, лесно е да се добијат неочекувани ефекти со намалување на бројот на остатоци под 20.
2. Намалете го бројот на хидрофобни остатоци
Пептидите со голема доминација на хидрофобни остатоци, особено во регионот 7-12 остатоци од C-крајот, обично предизвикуваат синтетички тешкотии.Ова се гледа како несоодветна комбинација токму затоа што во синтезата се добива лист со превиткување Б.„Во такви случаи, може да биде корисно да се конвертираат повеќе од два позитивни и негативни остатоци или да се стават Gly или Pro во пептидот за да се отклучи составот на пептидот.
3. Намалување на регулацијата на „тешките“ остатоци
„Постојат голем број остатоци од Cys, Met, Arg и Try кои обично не се синтетизираат лесно.Сер обично ќе се користи како неоксидативна алтернатива на Cys.
Дизајн шема и раствор на полипептиден пептиден синџир

Трето, подобрување на правилниот избор на растворливи во вода
1. Прилагодете го N или C завршетокот
Во однос на киселите пептиди (односно, негативно наелектризирани на pH 7), особено се препорачува ацетилација (N-терминална ацетилација, C крај секогаш одржува слободна карбоксилна група) за да се зголеми негативниот полнеж.Меѓутоа, за основните пептиди (т.е. позитивно наелектризирани на pH 7), особено се препорачува аминација (слободна амино група на N-крајот и аминација на C-крајот) за да се зголеми позитивниот полнеж.

2. Во голема мера скратете ја или издолжете ја низата

Некои од секвенците содржат голем број на хидрофобни амино киселини, како што се Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr и Ala, итн. Кога овие хидрофобни остатоци надминуваат 50%, тие обично не се лесно да се растворат.Може да биде корисно да се продолжи низата за дополнително да се зголемат позитивните и негативните полови на пептидот.Втората опција е да се намали големината на пептидниот синџир за да се зголемат позитивните и негативните полови со намалување на хидрофобните остатоци.Колку се посилни позитивните и негативните страни на пептидниот синџир, толку е поголема веројатноста тој да реагира со вода.
3. Ставете остаток растворлив во вода
За некои пептидни синџири, комбинацијата на некои позитивни и негативни амино киселини може да ја подобри растворливоста во вода.Нашата компанија препорачува N-крајот или C-крајот на киселите пептиди да се комбинираат со Glu-Glu.Даден е N или C завршетокот на основниот пептид, а потоа Lys-Lys.Ако наполнетата група не може да се постави, Ser-Gly-Ser може да се постави и во N или C терминал.Сепак, овој пристап не функционира кога страните на пептидниот синџир не можат да се променат.