На површината, формирањето на пептидни врски, со што се добиваат дипептиди, е едноставен хемиски процес.Ова значи дека двете компоненти на амино киселините се поврзани со пептидна врска, амидна врска, додека се дехидрирани.
Формирањето пептидна врска е активирање на амино киселина при благи услови на реакција.(А) дел од карбоксил, втора амино киселина (Б) Нуклеофилното активирано дел од карбоксил потоа го формира дипептидот (AB).„Ако карбоксилната компонента (А) не е заштитена, формирањето на пептидната врска не може да се контролира“.Нуспроизводите како што се линеарни и циклични пептиди може да се мешаат со целните соединенија AB.Затоа, сите функционални групи кои не се вклучени во формирањето на пептидната врска мора да бидат заштитени на привремено реверзибилен начин за време на синтезата на пептидите.
Значи, синтезата на пептид - формирањето на секоја пептидна врска - вклучува три чекори на агрегација.
Првиот чекор е да се подготват некои аминокиселини на кои им е потребна заштита, а цвитерионската структура на амино киселините повеќе не постои.
Вториот чекор е двостепена реакција за формирање на пептидни врски, во која карбоксилната група на N-заштитената аминокиселина прво се активира до активниот меѓупроизвод, а потоа се формира пептидната врска.Оваа поврзана реакција може да се појави или како реакција во еден чекор или како две последователни реакции.
Третиот чекор е селективно отстранување или целосно отстранување на заштитната основа.Иако целото отстранување може да се случи само откако ќе се склопат сите пептидни синџири, потребно е и селективно отстранување на заштитните групи за да се продолжи со синтезата на пептидите.
Бидејќи 10 амино киселини (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec и Cys) содржат функционални групи на страничен синџир, кои бараат селективна заштита, што ја прави синтезата на пептидите покомплицирана.Мора да се разликуваат привремените и полутрајните заштитни основи поради различните барања за селективност.Привремените заштитни групи се користат во следниот чекор за да се одрази привремената заштита на аминокиселинските или карбоксилните функционални групи.Полу-постојаните заштитни групи се отстрануваат без да се мешаат со веќе формираните пептидни врски или странични синџири на аминокиселини, понекогаш за време на синтезата.
„Идеално, активирањето на карбоксилната компонента и последователното формирање на пептидни врски (реакции на спојување) треба да биде брзо, без формирање на расемични или нуспроизводи, а моларни реактанти треба да се применат за да се постигнат високи приноси.За жал, ниту еден од методите на хемиско спојување не ги задоволува овие барања, а малкумина се погодни за практична синтеза.
За време на синтезата на пептидите, функционалните групи вклучени во различни реакции обично се поврзани со рачниот центар, единствениот исклучок е глицинот и постои потенцијален ризик од ротација.
Последниот чекор во циклусот на синтеза на пептиди е отстранување на сите заштитни групи.Селективното отстранување на заштитните групи е важно за продолжување на пептидниот синџир покрај барањето за целосно отстранување на заштитата при синтезата на дипептиди.Синтетичките стратегии треба внимателно да се планираат.Во зависност од стратегискиот избор, N може селективно да ги отстрани α-амино или карбоксилните заштитни групи.Терминот „стратегија“ се однесува на секвенцата на реакции на кондензација на поединечни амино киселини.Во принцип, постои разлика помеѓу постепена синтеза и кондензација на фрагменти.Пептидната синтеза (исто така позната како „конвенционална синтеза“) се одвива во раствор.Во повеќето случаи, постепеното продолжување на пептидниот синџир може да се синтетизира само со користење на пептидниот синџир за синтеза на пократки фрагменти.За да се синтетизираат подолги пептиди, целните молекули мора да се сегментираат на соодветни фрагменти и да се утврдат дека можат да го минимизираат степенот на диференцијација на C-крајот.Откако поединечните фрагменти постепено ќе се склопат, целното соединение ќе се спои.Стратегијата на синтеза на пептиди вклучува избор на најдобар и најсоодветен заштитен фрагмент, а стратегијата на синтеза на пептиди вклучува избор на најсоодветна комбинација на заштитни бази и најдобар метод за конјугација на фрагменти.
Време на објавување: 19 јули 2023 година