Што се пептиди кои продираат во клетките?

Пептидите кои продираат во клетките се мали пептиди кои лесно можат да навлезат во клеточната мембрана.Оваа класа на молекули, особено CPP со функции за таргетирање, ветува ефикасна испорака на лекови до целните клетки.

Затоа, истражувањето за него има одредено биомедицинско значење.Во оваа студија, CPP со различни трансмембрански активности беа проучувани на ниво на секвенца, обидувајќи се да ги откријат факторите кои влијаат на трансмембранската активност на CPP, разликите во секвенцата помеѓу CPPs со различни активности и NonCPPs и да се воведе метод за анализа на биолошките секвенци.

Секвенците на CPP и NonCPP беа добиени од базата на податоци на CPPsite и различни литератури, а трансмембранските пептиди (HCPPs, MCPPs, LCPPs) со висока, средна и ниска трансмембранска активност беа извлечени од секвенците на CPPs за да се конструираат множества на податоци.Врз основа на овие збирки на податоци, беа спроведени следниве студии:

1, Составот на аминокиселините и секундарната структура на различни активни CPP и NonCPP беа анализирани со ANOVA.Откриено е дека електростатските и хидрофобните интеракции на амино киселините одиграле важна улога во трансмембранската активност на CPP, а спиралната структура и случајното намотување исто така влијаеле на трансмембранската активност на CPP.

2. Физичките и хемиските својства и должините на CPP со различни активности беа прикажани на дводимензионалната рамнина.Утврдено е дека CPP и NonCPPs со различни активности може да се групираат под некои посебни својства, а HCPPs, MCPPs, LCPPs и NonCPPs биле поделени во три кластери, покажувајќи ги нивните разлики;

3. Во овој труд се воведува концептот на физички и хемиски центар на биолошката низа, а остатоците што ја сочинуваат низата се сметаат за точки на честички, а низата се апстрахира како систем на честички за истражување.Овој метод беше применет за анализа на CPP со проектирање на CPP со различни активности на 3D рамнина со методот PCA, и беше откриено дека повеќето CPP се групирани заедно, а некои LCPP групирани заедно со NonCPP.

Оваа студија има импликации за дизајнот на CPP и разбирање на разликите во низите на CPP со различни активности.Дополнително, методот на анализа на физички и хемиски центроид на биолошки секвенци воведен во овој труд може да се користи и за анализа на други биолошки проблеми.Во исто време, тие можат да се користат како влезни параметри за некои проблеми со биолошката класификација и да играат улога во препознавањето на моделите.